在与戈鲁戈姆战斗后半年,本应取回的和平突然被怪魔界克萊西斯帝国打破。克萊西斯帝国的杰克将军想拉拢南光太郎作为部下,但光太郎不答应,于是杰克将军便将其变身机能破坏。 变身机能破坏的情况下,光太郎被扔往宇宙。
《怪医黑杰克》最初在1973年11月19日发表于秋田书店的《周刊少年Champion》,连载到1978年9月为止。(1979年之后改为不定期单篇刊载) 此漫画于1975年获得第四届日本漫画家协会奖,1977年获得讲谈社漫画奖。
故事发生在遥远的未来,当时大陆板块的活动逐渐淹没了日本的大部分领土,迫使人们在海上建造新的城市。随着时间的推移,海洋城市的规模越来越大、越来越复杂,为了维持秩序,一种名为“蓝色美人鱼”的新型职业逐渐被公众所接受和渴望。