故事以赤穗藩（现在的兵库县）为舞台，讲述为了给在江户城松廊下伤人而被迫切腹谢罪的赤穗藩君主浅野内匠头报仇，四十七名浪人武士团结一致，向宿敌吉良上野介报仇……
其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、 手上握着不可思议的瓶子 。「变身！」―― 青年天才物理学者变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前！
打电话的是佑作学生时代的好友，两人已经很多年没有联络了。好友告诉佑作，学生时代一直喜欢着佑作的女孩雪子（须藤温子 饰）如今身患不治之症，时日无多了，好友希望佑作能够在雪子临死之前去探望她，了却她的心愿。就这样，佑作乘上了返回老家的火车，仔细算一算，他离开家乡已经28年之久了，此时的佑作并不知道，这趟返乡之旅将会改变他的命运。
