原来，古莉的真身是魔王的女儿，拥有一本法力强大的“亲吻笔记”，名字被写在笔记上的人，必须在二十四小时内同他人接吻，不然古莉便会死去。 在误打误撞之中，古莉将青司的名字写在了笔记本上，这也就意味着，如果无法接吻，青司将面临着“一辈子单身”的悲惨命运。外表单纯内里腹黑的绯山茜（沼仓爱美 配音）、傲娇活泼的空手道少女蓝野亚久亚（高桥李依 配音）、拥有着超强毅力的黄蝶崎柚（长野佑纪 配音），究竟是谁能够帮助青司走出困境？
原来，和父亲在中国修炼的时候，乱马掉入了溺女泉，于是拥有了一碰冷水就会变身成女人的体质。在莫名其妙中，早云居然将小茜许配给了乱马，这让个性要强的小茜不能接受。 乱马就读了当地的风林馆高中，在学校里，他遇见了诸多有趣的朋友和强大的对手，在每日打打闹闹的生活上，小茜和乱马之间的感情也产生了微妙的变化。
在危急的情况下，特勤局NERV的葛成美救出了真嗣，并在西本的指挥下将他带到了NERV的总部。但迎接真嗣的是他父亲的冷酷命令：驾驶一个名为“EVA”的巨大人形机器人与使徒作战。Shinji已经表示拒绝，在看到严重受伤的替补司机Ayumi后，他决定遵守父亲的命令。就这样，从未接受过作战训练的真嗣准备驾驶长荣第一架飞机对抗使徒。世界的命运交给了一个14岁的男孩，而隐藏在“第二次冲击”中的“人类完成计划”似乎也开始采取行动。掌握了所有答案的隐元都只是观察，没有任何动作，好像一切都已经写进了剧本。
