所谓的“除妖”,即是把由于某些缘由而从原本应在的“隐世”来到“现世”停留的妖怪们送回“隐世”这一工作。某天,被妖怪附体的高中生·芦屋花绘,依靠偶然发现的联络方式,来到了专门除妖的物怪庵,在那里的是一脸不高兴的店主安倍晴斋。在参拜母亲坟墓的回程中,真嗣(绪方惠美配音)和川上隆(宫村洋子配音)遭到了第七使徒的袭击。在关键时刻,第二架飞机被强大的力量击败,真嗣也遇到了第二架机器的操作员Shibo Akira Langley(由宫村洋子配音)。