毕业于东京大学法律系的中山晴树（永山绚斗 饰）现今在前原光朗（岸部一德 饰）经营的事务所内担任律师，此前他和护士本宫泉美（莲佛美沙子 饰）相知相恋，并且到了谈婚论嫁的地步。谁知就在某天，他意外见到了十年来都让他魂牵梦绕、无法忘怀的一张脸。
3000万年前，黑暗使世界陷入恐惧。最后，光明巨人将黑暗封印在遥远的宇宙中。光之巨人也用尽全力，在这颗红色星球上陷入了永恒的睡眠。时光飞逝，当地球和平联盟TPU紧急组建精英团体“GUTS-SELECT”时，主人公振中健吾正以植物学家的身份在新探索的火星上平静地生活着。但有一天，古印的黑暗又突然袭来，打破了生活的宁静。当火星的街道被怪物摧毁时，剑武在命运的指引下遇到了沉睡的光之巨人。这次遭遇会对他和地球产生什么影响？穿越时空觉醒的光之巨人被命名为Trija Ultraman。
为了防止基德得手，女王身边布置大批保镖和警力。中森警官是日本警方的总代表，而他的女儿青子以及基德的真身快斗也同在这列火车之上。 眼看离预定时间越来越近，快斗却始终没有找到宝石真正的藏匿地点。与此同时，国际宝石大盗杰卡尔和罗丝也尾随前来，他们企图在基德得手之际趁火打劫。同在火车上的柯南从伪装成乘务员的罗丝身上看出蹊跷。一场宝石的攻防战随即展开……
