这是一个五十年后的未来的空中故事,世界被“神”吞噬并被遗弃。由于怪物“野神”的突然毁灭而失去平衡。在人类文明中现有武器因饥荒之神的掠夺本能而失效的情况下,生化科技企业“芬里耶”利用饥荒之神细胞成功研制出了一种名为“神机”的生物武器。被各国分割统治的中世纪的神州·日本。在那上空中由八艘船组成的都市舰“武藏”航行着……在遥远的未来。经过了“重奏统合争乱”,并把联繫着人类的命运的“圣谱”作为原本历史的再现而执行的各国。