在距离东京300公里的凤凰岛上，一名男子被马踩踏致死。没想到，他的老搭档杉田优（水谷裕太饰）的Kobe Zun（菊川光博饰）找到了他。最初，这个私人小岛是为一个有自卫队背景的民兵组织提供训练基地，该组织似乎涉嫌制造生化武器。
光雄（北岛俊辅饰演）决心成为一名拳击手，并将所有的精力和时间都投入到这项事业中，希望有一天能赢得世界冠军的荣耀。有一天，光雄的哥哥（河野康志饰演）委托他照顾两只小猫，一只叫小黑，另一只叫小吉。
长久以来，五个世界相互制约抗衡，形成了微妙的平衡，然而一场意外的发生让这五个世界都将面临着同一个结局——毁灭。 为了避免这恐怖的未来图景成为现实，拥有“Excceed能力”的少女们挺身而出，她们被送往名为青兰学院的学校之中，在这里接受训练和保护。率真耿直的彩城天音（田村由加莉 配音）、沉默寡言的苍月纱夜（寿美菜子 配音）、优雅高贵的阿尔玛利亚（原由实 配音），在校园里，这些命运相似的少女们相遇了。
