《超级机器人大战·原创世纪》的背景是新西历，人类正式开始进出宇宙2世纪，但因为2次大型陨石的坠下，人们的生活还是维持在21世纪初。到了新西历179年，第3颗陨石“流星3(メテオ3)”坠落于南太平洋的マーケサズ群岛海面。
在最迷惘的时刻，由乃接到了一份来自间野山市的邀请函，邀请她前往那里就职，而她的职位竟然是“国王”。原来，间野山市曾经作为“迷你独立国”而名噪一时，然而，经济泡沫破裂之后，这个小小的国家便立刻沦为了无人问津的普通观光地。而由乃的任务，就是担任间野山观光协会的会长一职，重振间野山市的辉煌。
Yuma丹桐子（由Toshido Teresa配音）是一名高中二年级学生。尽管他看起来安静、严肃、内向，但实际上他有一段难忘的过去。为了避免再次伤害身边的人，悠玛选择了独自一人过着孤独的生活。
