小时候,日向翔阳从电视上看见排球比赛,乌野高中的一名小个子在球上的英姿,简直就是个“小巨人”。他对此印象非常深刻,并开始迷上排球,一直想成为“小巨人”一样的人。
故事发生在室江高中,身为剑道部的顾问,石田虎侍(小西克幸 配音)每一天都过着浑水摸鱼的懒散日子,剑道这项本该令人热血沸腾的运动在他看来,不过是一群小孩子的小打小闹而已。
地球已经很久没有被怪物入侵了,似乎已经恢复了和平。随着人类将目光进一步转向宇宙,与怪物灾难作斗争的团队规模正在逐渐缩小。就在这时,神秘的宇宙漂浮体“狮身人面像”突然对地球发动了攻击。地球和宇宙之间的联系已经被切断,成为一个“孤独的星球”。