神创造了一切生命，但同时也创造了所有邪恶。故事是从中空回廊封印的有机天使亚蕾克西儿之躯体被盗开始的。邪鬼族王女九雷与其堂兄紫罗九音，为了让亚蕾克西儿复活而前往人界寻找亚蕾克西儿灵魂所托之人，于是遇上了这一世亚蕾克西儿的持魂者——无道刹那。 当时刹那正陷入与其胞妹无道纱罗的矛盾苦恋中，无暇顾他。同时，偷跑来人界的智天使肯达为解救被封印的前炽天使长兼天使军总司令狂天使无机天使罗洁爱儿而实行“天使禁猎区”计划，揭开人界天界魔界新纪元的大事件即将发生......
这里是人、神、魔等种族共同生活的神秘世界，密斯塔尔希亚 过去，黑银之翼的巴哈姆特曾几乎令这个世界毁灭 但人，神，魔三族共同战斗 作出了巨大的牺牲后，终于把它的力量封印了起来 接着，神与魔两方分别保存着封印钥匙的一半 二千年以后，世界始终和平安宁 不知从什么时候起，人类将巴哈姆特当作了独一无二的尊贵存在，畏惧并崇拜它 某一天 一位少女夺走了保护严密的神族的钥匙 世界的均衡渐渐被打破 当巴哈姆特再次发出吼声之时 世界再次落入绝望的深渊 世界啊，毁灭吧！ 某个声音如此肯求着
适值此时，南太平洋海域传来发现宝藏的消息，哆啦A梦经不住大雄的软磨硬泡，同意展开这次寻宝大冒险。小伙伴们相继聚到一起，将目标锁定在加勒比海域一个名叫多摩斯的小岛上。他们的旅程原本充满乐趣，但是意外很快便发生。小伙伴们遭遇时空错乱，阴差阳错来到了17世纪。大雄被浪头冲走，下落不明。哆啦A梦等人被一艘海盗船救下，却弄丢了一次元空间袋。 海盗船船长吉德正准备前往金银岛寻找失踪的哥哥和侄子。哆啦A梦他们随船前往，殊不知更大的冒险即将到来……
