不知道多久前，世界各地出现了专门猎杀人类的巨人，可怕的天敌的出现最终导致了人类文明的衰落和逆转。为了防止巨人无休止的狩猎，人类建造了三堵高墙来保护自己，仿佛一百年过去了。年轻的艾伦（三浦春马饰演）厌倦了被监禁。
自从流川毕业后，水泽已经成为富中的顶梁柱，他不断磨练自己的球技，期待早日考入湘北和前辈流川一同称霸全国。而就在此刻，水泽遭遇人生最大的打击。他被诊断患上关节结核，剧烈的疼痛让他面临放弃篮球的命运。为了让水泽毫无遗憾的离开球场，走上手术台，他的姐姐茜找到晴子，希望能安排弟弟和流川共同打一场练习赛以了心愿…… 本片根据井上雄彦的同名漫画改编，为该动画的第四部剧场版。
