谁知当一切都按部就班进行之时，意外突然发生。与此同时，距离大使馆不远的一座摩天大楼内，日本首相遭到密码箱炸弹的暗杀，素子之前的上司陆军501机关的机关长库露兹（浅野麻由美 饰）也在爆炸中丧生。经过缜密追查，素子等人发现一种能够篡改记忆的病毒正在网络蔓延，而她的身世居然和一连串的事件有着密切联系。危机当前，阴谋悄然复出水面…… 本片根据士郎正宗的同名原作改编，系《攻壳机动队》诞生25周年纪念作品。
火风绀（江口拓也 配音）是一个平凡的少年，某一天，绀竟然被召唤到了被称为“米拉”的异世界之中。刚刚来到米拉，绀就发现了被敌方袭击而几乎全军覆没的爱卡尔拉特公主（三上枝织 配音）一行人，此刻，他们正遭到来自于邪恶教团的恐怖组织“因克古尼特”的攻击。在莫名其妙之中，绀打败了队长艾乐库（神谷浩史 配音），解救了公主。作为报酬，公主将带领绀到达都城寻找回到原来世界的方法。 忠心耿耿的骑士森格伦（中井和哉 配音），能文能武的侍女玛丽安戴尔（福山润 配音），可爱的宠物佩特（细谷佳正 配音），在这些同伴的陪伴下，绀踏上了前往都城的旅程。没想到，一路上危险如影随形，敌人不断骚扰，在这样恶劣的情况下，他们能够顺利到达终点吗？
佐伯丽奈（原奈津子 配音）是一名平凡的高中二年级女生，个性十分开朗活泼的她对世间的一切都充满了浓重的好奇心。朝比奈凉香（藤田奈央 配音）是丽奈的同班同学，一头利落短发的她，性格像男孩一样大大咧咧，不仅运动神经非常发达，成绩也常年霸占年级第一名的宝座。五十岚琉璃子（徳井青空 配音）是丽奈青梅竹马的玩伴，沉默寡言时常放空自己的她实际上拥有超强的灵感力，常常能看见别人看不见的东西。 故事围绕着三个女孩展开，她们利用超市里非常常见的廉价食材，却做出了能够让人感受到温暖的美味料理。
