一条晴彦(下野紘 配音)是一年级新生,亦是对策室的成员,他拥有能够使用绘画封印怪灵的能力,是足智多谋的军师。 川神舞(上坂堇 配音)是一条晴彦的学姐,个性开朗行事冲动的她常常惹出不少的麻烦,和晴彦组成了搭档相互取长补短居然格外的般配。除此之外,温文尔雅的千金大小姐和泉玲奈(早见沙织 配音),特立独行的孤高展示水无濑小系(内田真礼 配音),这些孩子们集结在一起,为了保护他们挚爱的朋友和家园向怪灵发起了宣战。
为了保护数码世界和数码兽,四圣兽之一朱雀兽接连不断的将帝魔送往人类世界,造成了危险和混乱,启人和好友牧野留姬(折笠富美子 配音)、李健良(山口真弓 配音)一起为了保护和平加入了战斗之中。不仅如此,朱雀兽还带走了掌握着数码兽进化关键的古乐兽,追随着古乐兽的踪迹,启人一行人闯入了数码世界,展开了大冒险。
隶属于总务部的马元ori(中野泰加饰演)通常处理局内的杂务。然而,他被命令监督铃木辅,铃木辅没有参与搜查。他们每个人怀里都抱着一个秘密,在逐一解决疑难案件的过程中,逐渐陷入了无法抗拒的命运漩涡。