2017年,E.U.联军132部队向圣彼得堡挺进,但遭到帝国军队的围困,面临全军覆没的危险。联军少校蕾拉·玛露卡尔(坂本真绫 配音)将旧日本青年组成非正规军W Zero部队,并提出以这支部队营救132部队的建议。但是在最为凶险的前线,他们不过肩负着牺牲自己来营救友军的悲哀命运。惨烈的对决过后,W Zero部队的中尉日向瑛斗(入野自由 配音)成功完成任务。 而战争还远远未曾结束,新的阴谋与危机浮出水面……
在平安度过世界末日的危机后,佛陀(星野源 配音)和耶稣(森山未来 配音)这两位圣者得到了难得的假期。他们相约来到岛国日本,体验人世间的春夏秋冬和喜怒哀乐。佛陀继续着自制T恤衫的爱好,耶稣则迷恋各种动漫电玩,为此常常令生活费趋紧。
二十世纪初的日本太正时代,自明治维新以来的文明开化已进行了五十余年。 随着西洋文化和日本传统文化的交汇融合,帝都·东京逐渐成为现代化建筑鳞次栉比,蒸汽铁道、地下铁道纵横交错,马车、人力车、蒸汽车川流不息的繁华都市。