为了防止犯罪团伙报复他,信义决定匿名并秘密追捕他们,希望能获得解药。有一天,新一的女友Maurilan来到阿里医生家,寻找她男朋友的下落。被小兰抓住的新一很快编造了自己的名字江户川柯南,然后柯南就和小兰在一起了。小兰的父亲森小五郎是一名私家侦探。新一可以利用他出去和他一起调查夜人的下落。柯南在小学时遇到了布美等小学生,他们一起组织了一支青年侦探队,向罪犯宣战!
升上高中后,卓也意外邂逅了名为渡良濑真水(永野芽郁 饰)的女孩,这个女孩因为患上了一种特殊的疾病,导致皮肤会发出异样的光芒,这种疾病是无法治愈的,这也就意味着,真水正在一步一步的走向不远处的死亡。 真水的疾病给卓也带来了很大的撼动,当他得知真水还有一些心愿没有了解时,便自告奋勇的宣布自己将会陪伴和帮助真水实现愿望。在此过程中,两人制造了无数难忘的幸福回忆,在死亡的引力之下,两颗心越靠越近。