曾经，一场可怕而又残酷的战争使整个大陆满目疮痍生灵涂炭，这场战争亦使“恶魔契约”成为了禁忌的代名词，从此成为历史，被封印在了滚滚的时间洪流之中。
季節は秋になり、結城理をはじめとしたペルソナ使いたちによる特別課外活動部と異形の怪物「シャドウ」との戦いにも、終わりが近づいていた。しかし、「影時間」を終わらせるためシャドウとの死闘を繰り広げる理の前に、謎の転校生・望月綾時が現れる。第3章監督は「銀河機攻隊マジェスティックプリンス」「デート・ア・ライブ」などを手がけてきた元永慶太郎。
故事发生在一个叫Glass Pu的海滨小镇，帝国大学物理学副教授Tomokawa Koji（福山康介饰演）在那里出差，住在一家名为“绿岩别墅”的酒店。在酒店里，汤川遇到了一个叫公平的男孩（山崎光饰演）。
