这时，瞄準鬼邪高中头目之位的SWORD内部的不良少年们， 也在虎视眈眈地等待著机会...。 其中，身穿深红色学生制服、被称為“血之门”的瀨之门工业高中的头目天下井公平(三山凌辉饰) 获得须嵜亮(中本悠太饰)这个最强男人的助力， 并将同样以掌控鬼邪高中為目标的镰坂高中和江骂罗商业高中纳入麾下，建立「三校联盟」并不断扩大势力。 鬼邪高中的高城司(吉野北人饰)和轰洋介(前田公辉饰)也很快就察觉到了三校联盟的可疑举动...就在这时三校联盟突然出现。 终於，三校联盟的鬼邪高中猎取行动开始了。 被突袭的鬼邪高中的男人们。 在完全处於劣势的状况下，一直用自己的拳头给出答案的枫士雄 究竟能否保护接连被击溃的伙伴们吗！？ 於是，枫士雄与三校联盟最强的刺客须嵜展开巔峰对决！ 枫士雄的拳头究竟会诉说什麼呢？ 角逐真正顶点的决胜之战拉开帷幕。
“暗杀课堂第二阶段课外讲座”将于3月11日起在dTV独家播出，该讲座与目前正在播出的电视动画版《暗杀课堂第II阶段》相关联。这一次，电视版没有包括动画，如《竹林中的一课》和《统治者的第二堂课》。
九州的阿苏地区接二连三出现去世的人重返亲人身边的事情，他们保持死亡之前的样子及记忆，为何能够死而复生？调查员川田平太（草剪刚饰）开始调查这个不可思议事件的产生原因。
