《屠杀器官》的舞台将设定在赛拉耶佛核爆后的地球,此时部分落后国家爆发了一连串内战及民族冲突,在这血腥风暴之中,美国特殊情报部队「克拉维斯(クラヴィス)」发现了在阴影之下有一名叫「约翰?保罗(ジョン?ポール)」的美国人参与其中,约翰路过之处必定掀起腥风血雨,这让众人疯狂的 「屠杀器官」到底是什么? 剧场版动画《屠杀器官》根据早逝的天才科幻小说作家伊藤计划的同名小说改编,由富士电视台的noitaminA节目企划,manglobe制作,将于2015年10月上映。
这部电影将描绘被称为日本历史上最大谜团的“本能寺事件”的前一天,以及一部追踪这一谜团的历史悬疑电影。故事开始于现代京都,即将结婚的可可(Ayase Yao饰演)正处于人生的岔路口,她住进了一家本能的寺庙酒店。