YUI是一个更健康的男孩，有能力治愈怪物的心脏，他小时候从父亲那里得到了一个神奇的瓶子。当Yu触摸瓶子时，她从液体中出来，默克。默克公司在你见到余之前没有任何记忆，他说他想知道自己是谁，两人去了不同的国家旅行。
三名女学生在没有太多营养的情况下进行了交谈，并在课堂上宣布了新学期的到来。女孩们不可替代的宝贵时光飞逝，季节也逐渐改变
在很久以后的未来，地面已经被污染到无法生存的程度，人类开始朝地底开发，并创造人工生命体代为劳动，没想到人工生命体反抗了人类接管了地底世界，而因为过度污染与新型态的病毒感染，原已所剩无几的人类又减损了近30%的人口，此时的人类以基因改造获得了长生，相对的也面对了自此失去生育能力的窘境，创造新生命成为人类世界复苏的关键。为了找寻失落的基因密码──“繁衍”，人类望向了曾经开发的地底世界开启了探索任务，同时因学生人数骤减而被舞蹈教室裁员的碰太，参加了地底任务的征选成为了被派往地底的英雄，只身前往充满未知恐惧的地底世界，惊人的地底探险就此开始……
