Matsuzaka Sugar是一名高中新生，她和一个叫Kobe Salt的女孩住在一间公寓里。Sugar相信她在这个世界上最爱的人就是盐。为了养活自己和盐，Sugar还努力在校外工作赚钱。
故事发生在一个名叫赫沙雷姆兹·罗斯的虚构城市。时间和空间的扭曲将不同的世界与人类世界联系在一起。因此，生活在不同世界的古代种族的“血亲”来了，对人类安全构成了巨大威胁。为了维护世界和平，一个名为“秘密社会Lebra”的秘密组织在黑暗中活动。
2048年，经过中央政府管理的人工智能筛选，一部分人类登上星际迁徙飞船“阿拉姆”，前往11.9光年外的鲸鱼座τ星E的旅程。然而，人类花了20年时间到达的这颗行星与地球之间的环境差距远超预期，使其不适合人类生存。移民飞船上有一个叫庆雄的年轻人。4岁时，他目睹了自己的父母被哥斯拉杀死。20年来，他一直想回到地球，摧毁哥斯拉。移民的可能性已经消失，飞船内部的生活环境变得越来越恶劣。以Haruhiro为中心的“重返地球派”已经成为主流，他们决定通过危险的长途子空间航行重返地球。然而，经过2万年的进化，地球已经形成了以哥斯拉为顶点的生态系统，完全成为了一个未知的世界。人类最终能夺回地球吗？庆雄的命运会怎样？
