一天，和平祥和的南戈市迎来了一位新成员，名叫大空一，他是一名热爱足球的小学生。作为一名队长，他的父亲常年出海，足球是他最好的玩伴。在这里，他遇到了石崎和大姐等真诚的玩伴，也遇到了球场上最初的对手吉弘。
巧合的是，与妹妹特尼特（佐佐木三泽配音）相依为命的杰（铃木大遥配音）在100年后来到了世界。杰震惊地发现他们以前的豪宅变成了一所学校。就这样，杰把自己的名字从匿名改为神功四高玛，开始在学校学习，同时寻找回到过去世界的方法。
然而，不屈斗志并没有放弃组建球队的理想，他决定带领懒散懦弱的队员们打一场漂亮的翻身仗。 训练计划已经制定，但执行起来却面临着重重的阻碍。在克服了各种各样的困难，遇到了数不清的挫折之后，球队总算是取得了他们的第一场胜利。之后，不屈斗志更是提出了一个听起来几乎不可能完成的计划，那就是称霸甲子园。
