故事发生在遥远的26世纪。外科医生伊德(克里斯托弗·沃尔茨克里斯托弗·沃尔兹饰)抱起一个只剩下头的机械女孩,把她带回家。她安装了最初为她死去的女儿准备的尸体,取名为Alita(罗莎·萨拉扎尔饰)。
28岁的小樱明(上田由纪饰演)是一名职业自由作家。一天,当她醒来时,发现自己躺在一间白色房间的床上。最初,这里是一家精神病院的隔离病房,只收治女性患者。Akira觉得自己已经失忆了,不知道自己是怎么来到这里的。
他的犬类智能伴侣“连”经常陪伴在他身边,他的朋友红雀(高桥宏配音)也很照顾他。然而,从那以后,苍野一直忍受着无法解释的头痛。与此同时,一款名为“Lime”的虚拟格斗游戏在岛上流行起来。一直对此不感兴趣的苍野,有一天在送货路上突然被一个神秘的人拉进了莱姆的陌生空间,被迫投入战斗。日益加重的头痛,肩上沉重的负担;神秘人物一再出现,都市传说“神隐”再次出现。苍野看似平静的生活,却在悄然发生着变化。这部动画改编自Nitro+CHiRAL于2012年发布的BL到AVG游戏。