故事发生在一所名为双科的高中，川端康子（桑原由纪配音）是那里的一名高中二年级学生。虽然他是个男人，但他可爱迷人，经常被不明真相的人误解。有一天，Yukawa Ji遇到了一个顽固的变态，他不仅偷了他的照片，还把照片卖给了公众。
一万年前,52张卡封印著不死的生命体,直到20世纪,这些封印被破解,使这些不死生命再次苏醒.为了阻止它们在人类的世界进行杀戮,并把他们再次封印於卡内,被称之为BOARD人类基盘史研究所的鸟丸开发变身腰带.而橘朔也和剑崎真一被委托成为假面骑士Garren和假面骑士Blade而展开他们的英雄之战.故事中的初期橘虽然有协助对抗不死生命体,但他亦对剑等人采取对抗态度,但到了故事的中段便恢复正常．故事中还有第三位由相川始变身的假面骑士，命名为卡利斯,他的正体是Undead－Joker，这亦正亦邪的角色令故事更增添丰富，最後出现的假面骑士是由睦月变身的假面骑士Leangle，一开始被梅花Ａ控制，後得剑和橘等人的帮助，最後亦恢复意志，成为正义的战士．
只有首相山本（石破浩饰）意识到形势的严重性，并任命田所的前妻稻盛浩（毛代一饰）为危机管理大臣，领导田所博士及其团队努力拯救日本。很快，从北海道开始，日本群岛发生了大规模地质灾害，引起了日本全国的恐慌。政府对这场灾难不知所措，唯一的海外移民政策无法应对迅速恶化的局势。日本岛屿完全沉没的现实即将展开。最终，田中博士和他的研究团队终于找到了拯救日本的方法，但这种方法的实际操作充满了困难。。。这部电影改编自日本科幻小说家小松左司的同名畅销小说。这部电影耗资20亿日元，是近年来日本电影业投资最多、推广最广的灾难片。
