「攻殻機動隊」の士郎正宗が原案、「エクセル・サーガ」の六道神士が漫画を手がけるコミック「紅殻のパンドラ」をアニメ化。先進国の一部ではサイボーグや自律ロボットが普及しはじめた時代。桐人、玉条、爱丽丝。六个月前,两名剑客和一名融合的骑士击败了最高牧师阿多梅尼斯·多雷特。战斗结束后,爱丽丝住在她的家乡卢利特村。在她身边,有一个铜仁,她失去了她最好的朋友,也失去了她的胳膊和心。