20世纪末,15岁的少年榊原恒一(阿部敦 配音)由于父亲前往海外公干的原因,于是来到亡母的家乡夜见山市,暂住阿姨三神怜子(宮牧美沙代 配音)家中等待转入新的学校。
已经担任过警察的浅沙俊平(北村一宏饰演)回到母校帝国大学,邀请12岁的同学福山康树协助破案。汤川和他的团队抵达犯罪现场附近,一边欣赏海滩风光,一边寻找案件线索。随着谋杀案调查的进展,只想还原案件物理原理的汤川逐渐接近案件真相。然而,在这个时候,他还没有意识到人类的心脏也是一门科学。。。影片中还穿插了唐川和曹绍的故事。在海风的吹拂下,格拉斯·剃刀向Yukawa的学生Yano Valley(由长泽安美饰演)讲述了一个故事,讲述了他在大二时与年轻的Yukawi(由三浦晴饰演)结成搭档的故事。。。SP改编自系列小说《操纵》和《堕落》中的两个故事,与剧场版《嫌疑人X的牺牲》同日上映。
《简单易懂魔法科!》为魔法科高校的劣等生的官方SD动画,简单易懂魔法科!是由Q版的魔法科高校的劣等生中司波兄妹为大家解说魔法科高校中的内容、设定等的3分钟小剧场。