铃木奈美（白石和美饰演）是一个佛教女孩，总是追求“相似”。无论是工作还是恋爱，铃木对自己的要求都是只要她能做到相似。铃木有一个青梅竹马的恋人，名叫肯尼亚，多年来一直暗恋。他住在繁华的大都市东京。
值此危急时刻，公安九课少校的草薙素子（坂本真绫 配音）率领队员巴特（松田健一郎 配音）、陀古萨（新垣樽助 配音）等人迅速展开行动，与恐怖分子和黑客展开连番恶斗。这支个性满满且身怀绝技的机动部队，还要追溯到2027年6月的某天。时任陆军机密部队501机关中佐的真室在街头被人杀害，公安9课课长荒卷大辅（塾一久 配音）在墓地与生化人草薙素子首次邂逅。后者接受荒卷的委托追查真相，在这一过程中和巴特等人邂逅。这正是一段传奇部队“攻壳机动队”成立前夕的故事…… 本片根据士郎正宗的原作改编。
没心没肺的高中生三人组伊坂透（市原隼人 饰）、本部晓（柄本佑 饰）、玉城哲雄（平冈佑太 饰）及其青梅竹马南风原唯（井上真央 饰）生活在冲绳，被阳光和海水滋润，日子过得好不惬意。这样的生活因为透的一次邂逅而发生改变。
