这些女孩被称为“女巫”，自古以来就一直处于攻势之中，利用她们隐藏的魔法与威胁人类生存的各种怪物作战。在由神奇女孩组成的机械化空中步兵的抵抗下，外星军最终撤退，这些女孩也成功撤退并分散在世界各地。其中一位是美丽的女孩宫户芳佳（由富原美里配音）。战争结束后，她回到了家乡扶桑王国，目标是成为一名优秀的医生。这一天，扶桑皇家海军学校的学生Shigeru Nobuyoshi（上田彩配音）前来参观，并邀请方家前往欧洲葡萄园公国学习。拥有绝技的美丽魔法女孩从四面八方再次聚集，开心地开着玩笑，却没有意识到不死的外星军队正在悄悄靠近
一天，在上学的路上，在樱花的山坡上跳舞，他遇到了一个叫顾和珠（中原马伊配音）的年轻女孩，从此他的生活发生了变化。在因病休学一年后，朱回到校园，对周围的环境感到很不舒服。她想加入戏剧系，但该系早已关闭。彭丽媛还决定帮助她一起开展戏剧系的活动，两人的关系也越来越密切。不久之后，彭于晏还在图书馆里遇到了一个名叫Kimi Ichiji（由Minamoto Maeko配音）的天才女孩。《CLANAD》是根据Key Society的同名游戏改编的京都动画电视版动画。该动画以游戏原作《小川线》的主要情节为特色，并穿插了其他女主角的相关情节。
