3000万年前，黑暗使世界陷入恐惧。最后，光明巨人将黑暗封印在遥远的宇宙中。光之巨人也用尽全力，在这颗红色星球上陷入了永恒的睡眠。时光飞逝，当地球和平联盟TPU紧急组建精英团体“GUTS-SELECT”时，主人公振中健吾正以植物学家的身份在新探索的火星上平静地生活着。但有一天，古印的黑暗又突然袭来，打破了生活的宁静。当火星的街道被怪物摧毁时，剑武在命运的指引下遇到了沉睡的光之巨人。这次遭遇会对他和地球产生什么影响？穿越时空觉醒的光之巨人被命名为Trija Ultraman。
此时在江户出现了一个名叫“暗夜的茶花”的盗贼， 实际上她们是一群表面上以云游表演为生的女子，其中最美的是一个叫椿(宫泽理惠 饰)的女子。病叶偶然邂逅了椿，两人相爱了。假扮成尼姑的恶鬼首领美惨(樋口可南子 饰)，无意中发现了椿肩膀上的阿修罗王的标记，可是椿对此一无所知，在美惨的推波助澜下，在病叶与椿结合的一瞬间真相终于浮出水面。鬼王阿修罗重生，阿修罗城出现在了世人面前。
