14年前，第一架飞机被怀疑是第一种神化形式的觉醒带来了近三次冲击，在世界上引发了前所未有的动荡。之后，前NERV成员，如葛成梅丽（三石琴配音）逃离并建立了Wille，Wille反抗Seele和NERV。
通过躲避帝国的追捕和遇到星晶兽，两人加深了联系，并逐渐发展壮大。但去星岛的旅程只进行了一半。青少年、女孩和同伴一起踏上下一段旅程。
这位年轻英俊的30岁邮递员（佐藤健饰演）被诊断出脑部患有恶性肿瘤，他的生命只剩下半年左右了。在一个无助的时刻，自称魔鬼、长相酷似邮递员的阿罗哈（佐藤健饰）出现在邮递员面前。
