14年前,第一架飞机被怀疑是第一种神化形式的觉醒带来了近三次冲击,在世界上引发了前所未有的动荡。之后,前NERV成员,如葛成梅丽(三石琴配音)逃离并建立了Wille,Wille反抗Seele和NERV。
事实证明,在富士树海出现了一条连接到另一个世界的时空隧道。在隧道的另一端,有一个叫“Eldante”的国家,Shinichi的工作是去这个国家,在那里推广他最熟悉的“家园文化”。在另一个世界里,神一遇到了温柔贤惠的精灵女仆弗兰(由三毛玲子配音)和叛逆叛逆的埃尔丹特帝国皇帝彼得拉卡(由舞蹈配音)。在两个可爱的女孩之间徘徊,等待神一的会是什么样的体验?
故事从第一部开始,讲述了五个年轻人的故事,他们分别是宫子龙太郎(松本龙太郎饰演)、吉田春彦(小野健男饰演)、高本恩达(宫城和也饰演)、矢川忠雄(樱井忠雄饰演)和冈野信(森康树饰演),他们在大学毕业后各自走上了自己的人生道路。