一代才女萱姬（夏文溪饰）不肯做妻妾，带着侍女绿巧（林凯玲饰）成为女道士。然而，她不安分、无拘无束的个性难以控制，经常外出与诗人、诗人交往。一天，在湖中游泳时，玄机遇到了主人公崔伯厚（万梓良饰演）。在他们聊天的时候，玄机做了一个私人承诺。
一天，和平祥和的南戈市迎来了一位新成员，名叫大空一，他是一名热爱足球的小学生。作为一名队长，他的父亲常年出海，足球是他最好的玩伴。在这里，他遇到了石崎和大姐等真诚的玩伴，也遇到了球场上最初的对手吉弘。
值此危急时刻，公安九课少校的草薙素子（坂本真绫 配音）率领队员巴特（松田健一郎 配音）、陀古萨（新垣樽助 配音）等人迅速展开行动，与恐怖分子和黑客展开连番恶斗。这支个性满满且身怀绝技的机动部队，还要追溯到2027年6月的某天。时任陆军机密部队501机关中佐的真室在街头被人杀害，公安9课课长荒卷大辅（塾一久 配音）在墓地与生化人草薙素子首次邂逅。后者接受荒卷的委托追查真相，在这一过程中和巴特等人邂逅。这正是一段传奇部队“攻壳机动队”成立前夕的故事…… 本片根据士郎正宗的原作改编。
