新闻报道显示发生了网络恐怖袭击。故事的主人公是一位名叫Yashin Taichi的五年级小学生，他住在东京郊区的一套高层公寓里。为了准备周末夏令营，独自呆在家里，我的母亲和去了涩谷的姐姐靖国登上了一辆势不可挡的电车。为了救他的母亲和妹妹，太一匆忙赶往涩谷。当他到达车站站台时，一个不可思议的现象发生了，太一走向了数字世界！孩子们遇到了他们的伙伴数码兽，一起面对未知的“冒险”！
不久，日番谷临阵逃脱的报告传遍尸魂界，黑崎一护（森田成一 配音）从二番队队长碎蜂口中得知始末，之后遇见并救助了体力不支倒地的日番谷，继而得知袭击护送队伍且与日番谷交手的是一个早已死掉的死神草冠。这两个人当年曾是莫逆之交，他们的关系也让袭击事件变得扑朔迷离。日番谷的暧昧态度零十番队遭受软禁处罚，而草冠的背后有隐藏着怎样的势力和秘密？ 本片根据日本漫画家久保带人的同名原著改编，系该动画的第二部剧场版。
