自己的阳台栏杆上出现了像被单一样挂在上面的少女,这种非现实的情节出现在了上条当麻的眼前。虽然在这个城市——最先进科学引导的学院都市中,超能力已经可以通过科学技术创造出来,但是眼前这位自称“茵蒂克丝”的少女还是把上条当麻吓了一条。失去阿尔梅多尼亚首都贝恩的王储朱利叶斯为了恢复自己的权利,向《人类宣言》的发起者大凯撒帝国寻求帮助。大凯撒帝国玛丽亚女王的妹妹琼·尤弗里亚代表帝国协助阿米多尼亚进行谈判。不仅仅是阿尔弗雷登和阿米多尼亚,事情的发展方向即将影响整个大陆的命运。