它于1881年举行。随着西方化的迅速发展，对政府不满的人数增加，监狱里挤满了囚犯，越狱也被推迟了。然后，政府在滋贺县琵琶湖设立了一个笼子，专门关押重罪犯，以及无法逃到日本的琵琶湖监狱和监狱大门。
故事描述女主角小樱（木之本樱）与男朋友小狼（李小狼）和其他同学从小学毕业后升上初中的故事。 在一次小樱做梦梦到53张樱之卡上面的图案都消失了，一名神秘人物出现之后库洛牌都碎掉了， 小樱从这个梦醒来翻开封印之书发现库洛牌都变成透明的了! 在与知世、小狼和艾力欧的讨论下，小樱重新踏上了收集透明牌的故事。
他们对昆虫进行研究和记录，并接受人们的委托来解决昆虫引起的奇怪事件。故事的主人公音谷（由中野裕斗配音）就是这样一个流浪的昆虫大师。他有一头银发，只用一只眼睛看东西；我经常嘴里叼着烟，背着一个大背包，翻山越岭，追寻昆虫的足迹。从第一季开始，《昆虫大师》就深受观众的喜爱。在沉寂了几年之后，这部电视动画系列已经重启，制作团队由原班人马组成。这一次，《昆虫大师》的续集将动画化原作的整个情节。
