《创圣大天使LOGOS》讲述由于SNS的普及，现代的无意义文字正在增加。在文字的世界LOGOS WORLD，发生了影响到现实世界的异常事态。灰吹阳等创声部的成员为了解开文字中隐含的意义，直面世界的危机。
昆虫既不是动物，也不是微生物，而是自然界中无处不在的力量，拥有独特的生命形式，偶尔与人类生活发生交集，孕育出一些精彩的故事。但即使人们意识到“昆虫”的存在，大多数时候他们也不知道如何应对，这需要“昆虫大师”出面。阴谷是个蠕虫大师。
一天，一位名为三千里切那（铃木达央 配音）的男子被海浪冲到了沙滩上，失去了重要的记忆的他，只知道自己背负着拯救世界的使命。在岛上，切那邂逅了只在夜晚出门的顽固家里蹲御原凛音（田村由香里 配音）、个性大大咧咧有些男孩子气的枢都夏莲（阿澄佳奈 配音）和拥有着悲惨身世灵感力极强的伽蓝堂纱罗（山村响 配音）。
