一次偶然中,驱与由佳被传送到了一个天上有一轮红色月亮的异世界,在这里,他们成为了一些外形可怖的怪物的猎杀对象。好不容易死里逃生回到原来世界的驱发现,那个被称为“赤夜”的时空正在慢慢侵蚀正常的世界。 共有七人被卷入“赤夜”战争,他们的共同点便是均为绫女丘市虹绫馆学园的学生,为了生存,为了查明事件的真相,也为了保护自己所爱的人们,这命运选定的六人必须齐心协力,共同战斗。
内容为--被认为是地球联邦政府暗中操控的“比斯特财团”将把最高机密“拉普拉斯之箱”交给新吉恩的残党军“袖付”。 另一方面,在安纳海姆工业专门学校就读的少年巴纳吉·林克斯遇见了自称为奥黛丽·本的少女(实为旧吉恩公国次男多兹鲁·扎比之女,美耐巴·扎比)奥黛丽为了制止新的战争爆发,必须组织“拉普拉斯之箱”的交易。巴纳吉在数次帮助奥黛丽之后,逐渐被她所吸引。 随后,地球联邦察觉了这起交易,并进行军事介入,工业殖民地随即化为一片火海。巴纳吉和同伴一边避难一边寻找着奥黛丽,而出现在他面前的是比斯特财团的当家卡迪阿斯·比斯特。奄奄一息的卡迪阿斯将出生的秘密告诉了巴纳吉,并且将箱之钥匙--“机动战士高达独角兽”托付给他。 随后,一场围绕“拉普拉斯之箱”的战争开始了……
在风之街“风都”,左翔太郎、拍档菲利普以及所长鸣海亚树子三人经营着侦探事务所。看似一片和平的风都背后,神秘组织在地下流通着能让普通人变成Dopant的“恶之盖亚存储条”。