故事开始于第一季的七年后。高达模型的战斗规则已经进行了改革,使其在战斗中更受欢迎。尽管易志诚和凌斯获得了世界大赛第七届dare模特大赛的冠军,但这也给学校的盛峰学园带来了很多荣耀。
在四百年后的未来,曾经的蓝色地球被黄沙覆盖,自然环境极其恶劣。伴随着它,古老的人类文明枯萎了,绝大多数幸存者搬到了地球附近的外太空,并在一个名为Diva的设施中定居。
表面上,高岭清麿(樱井孝宏 配音)是一个个性孤僻不爱上学的不良少年,但他其实是个拥有超高智商的天才少年。某日,一个外表奇特的男孩找到了清麿,男孩告诉清麿自己叫卡修(大谷育江 配音),此行前来的目的是为了报恩。