樱井奈奈(花泽香菜 配音)是一位平凡而又善良的可爱女生,某日,奈奈在网上看到了方南STRIDE部比赛的画面,被这项穿梭在大街小巷之中的运动深深吸引,产生了加入的念头。就这样,奈奈进入方南高中,加入了STRIDE部,开始了在这里的学习生活。
她的念头似乎触怒了专横的榭尔,因此惹来杀身之祸。危急之时,芭洛特得到犯罪搜查官乌夫库克博士(八岛智人 配音)的救助,并在马杜克紧急法令09的庇护和允许下,拥有了法令禁止的特殊能力。乌夫库克希望借助少女之手,揭露榭尔一系列的罪行。对她来说,这不啻为一次凶险的旅程…… 本片根据冲方丁的科幻小说改编,为“壳中少女”三部曲中的第一部(另两部分别为“燃烧”和“排气”)。
故事发生在一个叫Sakura Shin的小镇上,那里的人类和怪物打着和平的幌子生活在一起。然而,盛开的樱花带来了危机的预兆,越来越多的怪物出现在这里,人类和怪物的世界也开始融合。为了应对这场危机,“碧泉生命咨询公司”的成员挺身而出。