七个具有生命的人偶,七个美丽夺目的少女,她们已经超越人偶的存在,拥有不变的容颜,强大的力量。但却没有一个是父亲心里最完美的爱丽丝。痛苦的罗真消身匿迹,留下的蔷薇少女们。
公元2176年,位于太阳系附近的恒星多鲁突然发生爆炸,巨大的能量使附近的宇宙空间充满了大量电磁波。太阳系也受到了波及,严重的电磁辐射使地球的自然环境发生了巨大的变化,变得不再适合于人类的生存。于是,人类开始了一场异常浩大的移民工程。
半年前,一系列的遭遇彻底改变了小学三年级学生高木直也(田村由里配音)的生活。作为一个神奇的女孩,她遇到了她可爱的小朋友Yuno Screaya(水木和树饰演),并通过与Fiat Testrosa(水木直也配音)深深锁住的秘密和麻烦的一系列激烈战斗,成为了一个难忘的朋友。新学期开始时,巴菲特以小学生的身份转到奈耶的班上,一切似乎都进入了稳定期。在一个没有任何警告的夜晚,Naiya和Fitte遭到了三名非法移民的袭击,其中包括持有黑暗之书的Vita(Mae Maeda配音),他们的法宝也被摧毁。新的危机,新的对手,一切都在朝着不可预测的方向发展