人世间存在着大大小小的谜团,当这些谜团被解开之时会释放出或强或弱的能量,食脑奈罗(子安武人 配音)就是专门食用这些能量的魔族,当魔界再无可以解开的谜团之后,他来到了人世,只为了寻找那能够满足他的极致的谜团。
喜欢神秘事物的东树自然很快乐,但科罗的脑海里充满了入侵地球的事情。他们在那里发现了废墟,因为迷路了,但后来由于意外情况不得不逃离那里。但就在这时,东树看到一个女孩在一瞬间迷失了方向。抱着女孩的神秘感,东树和科若罗回到了东京。但就在这时,最强大的敌人出现在他们面前。它看起来和KERORO一样,但与KERORO不同的是,他想迅速彻底地计划入侵地球的黑暗KERORO。他率领部下CIBABA、DORURURU和MIRURU在世界各国发动侵略行动。与这一切作斗争的科罗队的命运是什么