游戏以前作 2 年后的日本乡村小镇“稻羽市”为舞台，玩家将扮演刚转学到稻羽市八十神高中 2 年级的主角，在追查神秘连续杀人事件时，潜在的“PERSONA”能力觉醒，同时也开启了进入异世界的大门，与其他 PERSONA 召唤者一同挑战神秘的迷宫。 游戏承袭前作的基本系统并加以强化，结合校园冒险与迷宫战斗 2 大部分。冒险部分将让玩家体验与形形色色的夥伴结交与互动的过程；战斗部分则让玩家与夥伴组队深入本作全新登场的乱数产生迷宫，发挥各自的 PERSONA 之力对抗异世界的神秘怪物。
Hohara Shiheko（青井义子饰演），一个与源氏（安倍隆饰演）同名的男人，过着同居的生活。虽然住在同一个屋檐下，但实和子和源氏之间的关系并不是一段浪漫的关系。
1989年是日本昭和64年，但这一年并没有持续太久。随着天皇的去世，短暂的昭和64年很快结束了。在这短短的七天内，某个地方发生了一起绑架年轻女孩的案件。绑架者要求2000万日元的巨额赎金，并巧妙地与受害者家属和调查人员进行了安排。
